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線(xiàn)粒體是真核細(xì)胞的一種細(xì)胞器，有它自己的基因組，這些基因組統(tǒng)稱(chēng)為線(xiàn)粒體基因組。經(jīng)過(guò)漫長(zhǎng)研究，如今線(xiàn)粒體基因組論文研究成果有很多，本文學(xué)術(shù)顧問(wèn)給大家整理了一些分享給大家。
線(xiàn)粒體基因組論文一：小長(zhǎng)蝽線(xiàn)粒體基因組全序列測(cè)定與長(zhǎng)蝽總科系統(tǒng)發(fā)育分析
摘要：為了了解小長(zhǎng)蝽Nysius ericae(Schilling)線(xiàn)粒體基因組結(jié)構(gòu)及長(zhǎng)蝽總科的分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。本試驗(yàn)采用Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)小長(zhǎng)蝽線(xiàn)粒體基因進(jìn)行測(cè)序，對(duì)基因組序列進(jìn)行拼裝、注釋和特征分析，利用最大似然法和貝葉斯法構(gòu)建基于12種長(zhǎng)蝽總科昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體全基因組核苷酸序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。小長(zhǎng)蝽線(xiàn)粒體基因組全長(zhǎng)為16 330 bp(GenBank 登錄號(hào)：MW465654)，基因組包括13個(gè)蛋白編碼基因(PCGs)，22個(gè)tRNA基因，2個(gè)rRNA基因和1段非編碼控制區(qū)。11個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的起始密碼子為典型的ATN;cox1，nad4l的起始密碼子為T(mén)TG。cob的終止密碼子為T(mén)AG，其余蛋白編碼基因的終止密碼子為T(mén)AA。只有trnS1缺少DHU臂，其余tRNA基因均能形成典型的三葉草結(jié)構(gòu)。12種長(zhǎng)蝽總科昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體全基因組序列構(gòu)建的昆蟲(chóng)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)結(jié)果顯示，小長(zhǎng)蝽與Nysius plebeius具有更近的親緣關(guān)系，且與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類(lèi)基本一致。小長(zhǎng)蝽線(xiàn)粒體基因組符合長(zhǎng)蝽總科線(xiàn)粒體基因組的一般特征。結(jié)果表明小長(zhǎng)蝽與N. plebeius的親緣關(guān)系更近。
關(guān)鍵詞：小長(zhǎng)蝽;半翅目;背孔長(zhǎng)蝽亞科;線(xiàn)粒體基因組;系統(tǒng)發(fā)育;
線(xiàn)粒體基因組論文二：基于太平洋甲脅虱裂化線(xiàn)粒體基因組推測(cè)甲脅虱屬祖先線(xiàn)粒體核型
摘要：【目的】動(dòng)物典型的單一染色體線(xiàn)粒體基因組在甲脅虱屬Hoplopleura已裂化成多個(gè)線(xiàn)粒體微環(huán)染色體。本研究旨在通過(guò)測(cè)定太平洋甲脅虱Hoplopleura pacifica的線(xiàn)粒體基因組來(lái)推測(cè)甲脅虱屬祖先線(xiàn)粒體核型�！痉椒ā坷肐llumina HiSeq X Ten高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)太平洋甲脅虱裂化線(xiàn)粒體基因組進(jìn)行測(cè)定,分析其結(jié)構(gòu)特征與變異情況;用最大似然法和鄰接法構(gòu)建7科7屬15種吸虱的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù);用簡(jiǎn)約法推測(cè)甲脅虱屬祖先線(xiàn)粒體核型�！窘Y(jié)果】太平洋甲脅虱線(xiàn)粒體基因組測(cè)序獲得29個(gè)基因(11個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,16個(gè)tRNA基因以及2個(gè)rRNA基因),且不均勻地分布于10個(gè)線(xiàn)粒體微環(huán)染色體上,每個(gè)線(xiàn)粒體微環(huán)染色體的編碼區(qū)包括1～5個(gè)基因,大小在690～1 773 bp之間。甲脅虱屬內(nèi)物種線(xiàn)粒體微環(huán)染色體組成差異較小,與吸虱亞目(Anoplura)其他屬相比,甲脅虱屬線(xiàn)粒體微環(huán)染色體的基因組成和基因排列有差異,但這種差異僅限于tRNA基因。進(jìn)化樹(shù)強(qiáng)烈支持吸虱亞目分為兩大進(jìn)化支,一個(gè)大的進(jìn)化支包括甲脅虱科(Hoplopleuridae)、多板虱科(Polyplacidae)、血虱科(Haematopinidae)和微胸虱科(Microthoraciidae),另一個(gè)大的進(jìn)化支包括虱科(Pediculidae)、陰虱科(Pthiridae)和猴虱科(Pedicinidae)。甲脅虱屬祖先線(xiàn)粒體核型由12個(gè)線(xiàn)粒體微環(huán)染色體組成,每個(gè)線(xiàn)粒體微環(huán)染色體由一個(gè)編碼區(qū)和一個(gè)非編碼區(qū)構(gòu)成,編碼區(qū)包含1～6個(gè)基因。【結(jié)論】本研究首次測(cè)定并分析了太平洋甲脅虱裂化線(xiàn)粒體基因組,并與迄今為止測(cè)序的另外2種甲脅虱的線(xiàn)粒體基因組進(jìn)行了比較,推測(cè)出甲脅虱屬祖先線(xiàn)粒體核型。 還原
關(guān)鍵詞：甲脅虱屬;太平洋甲脅虱;線(xiàn)粒體基因組;線(xiàn)粒體微環(huán)染色體;線(xiàn)粒體核型;基因組裂化;
線(xiàn)粒體基因組論文三：玉米線(xiàn)粒體基因組密碼子偏好性分析
摘要：為研究玉米(Zea mays)線(xiàn)粒體基因組的密碼子偏好性，本研究以玉米亞種NB線(xiàn)粒體基因組為例，篩選出155條編碼基因序列，通過(guò)生物信息學(xué)方法分析其密碼子的使用模式。結(jié)果顯示，玉米亞種NB線(xiàn)粒體基因組所編碼基因密碼子的GC含量與第一、第二和第三各位點(diǎn)的GC含量均小于50% (GC1， GC2， GC3)，表明玉米亞種NB線(xiàn)粒體編碼基因富含A和T堿基;有效密碼子數(shù)(effective number of codons， Nc)與GC、GC1、GC2、GC3、GC3s均正相關(guān);相對(duì)同義密碼子使用頻率(RSCU)>1的同義密碼子共有29個(gè)，其中僅有3個(gè)以G/C結(jié)尾，表明密碼子的第3位堿基使用偏好于A/T;中性繪圖和Nc-plot分析發(fā)現(xiàn)選擇壓力可能是導(dǎo)致玉米線(xiàn)粒體基因組密碼子使用模式之間差異的主要原因;最終通過(guò)高表達(dá)優(yōu)越密碼子方法確定了TTT、TTA、CTC等17個(gè)最優(yōu)密碼子，其中以A/T堿基結(jié)尾的最優(yōu)密碼子有12個(gè)。該研究結(jié)果有助于更好地了解玉米線(xiàn)粒體基因組密碼子偏好性規(guī)律，為提高外源基因在線(xiàn)粒體中的表達(dá)效率提供了科學(xué)依據(jù)。
關(guān)鍵詞：玉米亞種NB;線(xiàn)粒體基因組;密碼子偏好性;最優(yōu)密碼子;
